CSST长三角中心包括中国科学院上海天文台、上海交通大学、中国科学院紫金山天文台、南京大学、中国科技大学、中国科学院南京天文光学研究所等科研单位。其中，上海天文台是长三角地区科学中心的依托单位，是多功能光学设施科学数据系统的联合承研单位，同时承担CSST后端模块积分视场光谱仪、多通道成像仪的研制任务；中国科学院紫金山天文台是太赫兹模块的研制单位；中国科学院南京天光所是星冕仪模块的研制单位。此外，根据总体部科学委员会的分工要求，在科学研究方面，目前长三角中心牵头宇宙学、天体测量、太阳系天体、暂现源和变源方向，系外行星搜寻，参加星系科学、恒星科学方向，负责CSST后端模块积分视场光谱仪、多通道成像仪、太赫兹谱仪、星冕仪研制和特色科学研究相关工作，并在高效利用CSST数据方面开展前沿科学研究。

长三角中心建设的指导思想是以最大科学产出为导向，在CSST发射前的建造阶段对相关的重要科学问题进行预研究，并积极有效地做好科学研究的组织工作，广泛开展国内外学术交流。长三角中心的现有参与单位20多家，参加研究人员超110人；后期的长期运行还会有更多人员参与，并需要承担人员培养的任务。